生物医学工程 - 生物信息学课程大纲

课程概述

  • 学期： X个学期
  • 目标受众： 生物医学工程专业学生，对编程和生命科学有基础了解
  • 教学方法： 讲座、小组讨论、实验与项目、在线资源

第1周：生物信息学简介

  • 主题： 生物信息学定义与重要性
  • 学习目标：
    • 理解生物信息学在医学研究中的角色
    • 掌握基本概念和工具
  • 阅读/资源：

第2-3周：DNA序列分析

  • 主题： DNA序列解读与比对
  • 学习目标：
    • 学习BLAST和FASTA等工具
    • 理解基因组学的基本概念
  • 教学活动：
    • 实践使用BLAST进行序列比对
  • 评估： 小测验

第4-5周：蛋白质结构与功能

  • 主题： 蛋白质结构预测与功能分析
  • 学习目标：
    • 理解结构生物学的基本原理
    • 使用PDB和UniProt数据库
  • 教学活动：
    • 分析蛋白质结构并解释其功能
  • 评估： 作业：蛋白质结构预测报告

第6-7周：基因表达数据分析

  • 主题： RNA-seq和microarray数据处理
  • 学习目标：
    • 熟悉表达谱分析软件
    • 了解统计学在生物信息中的应用
  • 教学活动：
    • 数据清洗与可视化
  • 评估： 数据分析小项目

第8-9周：生物网络分析

  • 主题： 基因调控网络与代谢途径
  • 学习目标：
    • 学会使用Cytoscape等网络分析工具
    • 理解网络动力学和复杂系统
  • 教学活动：
    • 构建和解释简单的生物网络
  • 评估： 网络分析报告

第10周：案例研究与实践

  • 主题： 应用生物信息学解决实际问题
  • 学习目标：
    • 整合所学知识解决实际生物医学问题
  • 教学活动：
    • 分组项目：针对特定疾病分析相关数据
  • 评估： 组内项目演示与反馈

期末复习与考试

  • 主题： 课程回顾与综合测试
  • 学习目标：
    • 回顾整个学期的重要概念和技能
    • 准备期末考试
  • 教学活动：
    • 期末复习讲座
  • 评估： 期末考试

通过这个课程，学生将获得生物信息学的基本技能，能够运用到生物医学工程的实际项目中。每个阶段都旨在逐步加深理解和应用，以确保学生充分掌握课程内容。